混合物样品中含有不同分子量、不同溶解度和不同修饰的完整蛋白质，因此在进行蛋白全质谱鉴定时，样品经酶切消化成多肽片段，使用鸟枪法蛋白质组学对样品进行鉴定。鸟枪法蛋白质组学的原理是先将蛋白质样品消化成肽段，然后将肽段通过高效液相色谱（HPLC）法进行分离。分离后的肽段直接进入质谱仪进行分析。质谱分析包括了两个过程，一级质谱（MS1）及二级质谱（MS2）。一级质谱获取高效液相色谱MS1中洗脱的肽的质量-电荷比（m/z）和肽的强度（intensity）；二级质谱通过对肽段氨基酸序列进行确定，MS2选择单个肽段对其进行碎裂从而得到该肽段的谱图数据。检索软件根据二级质谱信息与相应的数据库比对，结合匹配度打分及错配过滤，可得到肽段的确切序列，进而拼接出各蛋白的完整序列，从而实现对蛋白的鉴定。

图 蛋白质组全谱鉴定流程图

适用场景

蛋白全质谱鉴定可对复杂样本进行蛋白种类分析，适用于生物组织、血液和微生物等复杂样品中蛋白质组分的分析，特别是适用于在某一特定生理状态下研究蛋白质的整体规律或特有蛋白。

实验周期

自送样起45个工作日。

客户下单及项目信息填写

在我司官网http://plant.biorun.com/进行注册或登录，请客户按照页面提示填写项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式，提交项目所需要的具体信息，包括：

1、样品来源、含量、状态及其他基本信息；

2、尽可能丰富的相关资料、文献。

实验信息

实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户，并发送实验报告查看网址。实验结题后，实验报告、检测结果可在线查看或打印，并永久保留。

实验交付内容

1、实验报告一份，含具体实验流程及蛋白质组鉴定及定量结果（生物信息学分析）；

2、生物信息学分析内容包括：

多肽、蛋白质鉴定；

鉴定结果特征分析：肽段程度分布、蛋白鉴定覆盖度、unique肽段数分布等。