背景说明
在植物基因功能研究中,反向植物遗传学是经典的研究思路之一,通常从一个基因入手,通过过表达、干扰或基因编辑等手段调节一个或多个基因的表达水平,观察对应的表型变化,从而对相关基因进行一系列的分子功能研究。
基因编辑技术主要是利用序列特异性核酸酶在特定基因位点产生DNA双链断裂,借助编辑受体自身的DNA修复系统在非同源末端连接(Non-homologous end joining,NHEJ)过程中产生随机的Indels (Small insertions and deletions)或在同源重组修复过程中插入或替换相应的基因片段,最终实现基因组序列的突变。现有的基因编辑系统主要包括锌指核酸酶(Zinc finger nucleases,ZFNs)系统、类转录激活因子效应物核酸酶(Transcription activator-like effector nucleases,TALENs)系统以及CRISPR/Cas(Clustered regularly interspaced short palindromic repeat-associated protein)系统,其中,CRISPR/Cas系统由于载体构建过程简单、编辑效率高等优点,成为当前广泛应用的主流基因编辑系统。2020年,Emmanuelle Charpentier和Jennifer A. Doudna两位科学家获得了诺贝尔化学奖,以表彰她们在“开发CRISPR/Cas基因组编辑方法”方面作出的贡献。
服务流程
服务内容及说明
在植物体系中,我司目前主要使用自主研发并改造后的pCAMBIA系列载体(无知识产权归属问题,Cambia机构已开放给任何人使用的权利,详情请见网站 http://www.cambia.org/daisy/cambia/585)。
我司原始基因编辑载体为双元载体,并携带卡纳原核抗性和真核筛选标记(可选潮霉素、Basta或G418进行筛选)。我们可以针对您想要编辑的靶序列,分析序列的各项参数后设计引物,选择最合适的原始基因编辑载体,退火合成靶序列,再连入原始载体, 得到重组子后直接进行遗传转化实验。
我司部分原始基因编辑载体列表。可根据不同的需求,选择不同的启动子及真核抗性的载体。
适用场景
1、 功能基因的敲除;
2、 非编码区的编辑,例如对启动子、microRNA、lncRNA的基因序列进行编辑;
3、 单碱基编辑、精准碱基编辑;
4、 非同源/同源多基因敲除、代谢通路多基因敲除;
5、 大片段删除。
优势特点
1、 采用我司已被授权的国际PCT专利技术(专利号:US 10,144,936 B2)来进行sgRNA的片段组装及无缝组装,同时,对于单个、 多个sgRNA序列均可进行组装;
2、 载体资源丰富,根据您研究的物种、靶序列,均有对应经多次编辑效率测试后的最优原始载体骨架推荐,也可个性化订制您有其它需求的基因编辑载体;
3、 基因编辑载体库中有多种真核筛选标记(可选潮霉素、Basta或G418进行筛选)的原始载体可供选择,同时,多基因编辑、单碱基编辑、精准碱基编辑等特殊基因编辑系统也可满足您的特殊实验需求;
4、 载体均为双元载体,可直接应用于后期单子叶和双子叶遗传转化;
5、 可以与我司转基因服务、检测服务、蛋白服务等衔接,整个实验可以畅通且快速地完成。
实验周期
5-7个工作日
样品接收标准
客户下单及项目信息填写:
在我司官网http://plant.biorun.com/进行注册或登录,请客户按照页面提示填写项目名称,选择项目类型[CRISPR/Cas基因组编辑载体]、项目所需要的具体信息,价格由系统自动计算。
实验信息
在实验开始、结题关键节点系统会自动发送短信到申请人手机进行告知,实验过程中客户可以随时登录客户管理系统査看项目实时进展情况。实验结题后,实验报告、检测结果可在线査看,并永久保留。实验过程用到的菌株、载体、受体材料免费为客户保存半年后销毁。
结题标准
目的片段构建至目的载体上(俗称“构建成功”)。
实验交付内容
1、重组载体的全序列信息和注释信息;
2、重组载体的酶切图谱;
3、重组载体的测序结果;
4、重组载体:一份质粒、一份大肠杆菌菌液(25%甘油菌);
5、如果需要转化农杆菌
1)2份农杆菌菌液(25%甘油菌)
2)农杆菌的检测图片。